MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus macedonicus ACA-DC 198 plasmid pSMA198

Total Repeats: 289

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016750	TGAA	2	8	50	57	50 %	25 %	25 %	0 %	373248556
2	NC_016750	AAAAG	2	10	64	73	80 %	0 %	20 %	0 %	373248556
3	NC_016750	CCA	2	6	172	177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	373248556
4	NC_016750	TC	3	6	195	200	0 %	50 %	0 %	50 %	373248556
5	NC_016750	AG	3	6	203	208	50 %	0 %	50 %	0 %	373248556
6	NC_016750	CTTT	2	8	218	225	0 %	75 %	0 %	25 %	373248556
7	NC_016750	AAG	2	6	260	265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373248556
8	NC_016750	T	6	6	292	297	0 %	100 %	0 %	0 %	373248556
9	NC_016750	AGA	2	6	306	311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373248556
10	NC_016750	TTTAAA	2	12	325	336	50 %	50 %	0 %	0 %	373248556
11	NC_016750	ATG	2	6	377	382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	373248556
12	NC_016750	CTTA	2	8	416	423	25 %	50 %	0 %	25 %	373248556
13	NC_016750	ACA	2	6	447	452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	373248556
14	NC_016750	A	7	7	678	684	100 %	0 %	0 %	0 %	373248556
15	NC_016750	GAA	2	6	691	696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373248556
16	NC_016750	A	6	6	739	744	100 %	0 %	0 %	0 %	373248556
17	NC_016750	GAA	2	6	780	785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373248556
18	NC_016750	ATA	2	6	800	805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373248556
19	NC_016750	AAAG	2	8	846	853	75 %	0 %	25 %	0 %	373248556
20	NC_016750	AGA	2	6	861	866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373248556
21	NC_016750	GCTA	2	8	870	877	25 %	25 %	25 %	25 %	373248556
22	NC_016750	AAAT	2	8	891	898	75 %	25 %	0 %	0 %	373248556
23	NC_016750	ATA	2	6	917	922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373248556
24	NC_016750	CT	3	6	989	994	0 %	50 %	0 %	50 %	373248556
25	NC_016750	ATG	2	6	995	1000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	373248556
26	NC_016750	TC	3	6	1041	1046	0 %	50 %	0 %	50 %	373248556
27	NC_016750	AAG	2	6	1064	1069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373248556
28	NC_016750	A	6	6	1102	1107	100 %	0 %	0 %	0 %	373248556
29	NC_016750	A	7	7	1171	1177	100 %	0 %	0 %	0 %	373248556
30	NC_016750	GAA	2	6	1272	1277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373248557
31	NC_016750	TAG	2	6	1327	1332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	373248557
32	NC_016750	AT	3	6	1346	1351	50 %	50 %	0 %	0 %	373248557
33	NC_016750	GTT	2	6	1352	1357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	373248557
34	NC_016750	ACA	2	6	1361	1366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	373248557
35	NC_016750	AAC	2	6	1456	1461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	373248557
36	NC_016750	CAA	3	9	1533	1541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	373248557
37	NC_016750	GAA	2	6	1572	1577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373248557
38	NC_016750	CAAT	2	8	1649	1656	50 %	25 %	0 %	25 %	373248557
39	NC_016750	GAAA	2	8	1712	1719	75 %	0 %	25 %	0 %	373248557
40	NC_016750	A	6	6	1749	1754	100 %	0 %	0 %	0 %	373248557
41	NC_016750	ACT	2	6	1855	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016750	GTTT	2	8	1905	1912	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016750	A	8	8	1913	1920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016750	AAG	3	9	1938	1946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016750	AG	3	6	1945	1950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016750	ATGA	2	8	1961	1968	50 %	25 %	25 %	0 %	373248558
47	NC_016750	TAT	2	6	1978	1983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373248558
48	NC_016750	AGA	2	6	2005	2010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373248558
49	NC_016750	A	7	7	2024	2030	100 %	0 %	0 %	0 %	373248558
50	NC_016750	T	6	6	2073	2078	0 %	100 %	0 %	0 %	373248558
51	NC_016750	TTCT	2	8	2082	2089	0 %	75 %	0 %	25 %	373248558
52	NC_016750	TC	3	6	2125	2130	0 %	50 %	0 %	50 %	373248558
53	NC_016750	A	6	6	2163	2168	100 %	0 %	0 %	0 %	373248558
54	NC_016750	TCA	2	6	2201	2206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	373248558
55	NC_016750	CAA	2	6	2228	2233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	373248558
56	NC_016750	TC	3	6	2244	2249	0 %	50 %	0 %	50 %	373248558
57	NC_016750	AAC	2	6	2268	2273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	373248558
58	NC_016750	AGG	2	6	2320	2325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	373248558
59	NC_016750	ATT	2	6	2337	2342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373248558
60	NC_016750	ACAA	2	8	2348	2355	75 %	0 %	0 %	25 %	373248558
61	NC_016750	ATG	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	373248558
62	NC_016750	AAAG	2	8	2381	2388	75 %	0 %	25 %	0 %	373248558
63	NC_016750	ATTT	2	8	2454	2461	25 %	75 %	0 %	0 %	373248558
64	NC_016750	TAAT	2	8	2469	2476	50 %	50 %	0 %	0 %	373248558
65	NC_016750	ATT	2	6	2544	2549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373248558
66	NC_016750	TGA	2	6	2566	2571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	373248558
67	NC_016750	A	6	6	2571	2576	100 %	0 %	0 %	0 %	373248558
68	NC_016750	CTG	2	6	2580	2585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	373248558
69	NC_016750	TCA	2	6	2662	2667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	373248558
70	NC_016750	TCTT	2	8	2690	2697	0 %	75 %	0 %	25 %	373248558
71	NC_016750	A	7	7	2718	2724	100 %	0 %	0 %	0 %	373248558
72	NC_016750	AAT	2	6	2810	2815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373248558
73	NC_016750	TAA	2	6	2834	2839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016750	A	6	6	2847	2852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016750	TTTA	2	8	2899	2906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016750	ATA	2	6	2917	2922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016750	T	6	6	2952	2957	0 %	100 %	0 %	0 %	373248559
78	NC_016750	GTT	2	6	2988	2993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	373248559
79	NC_016750	TAA	2	6	3010	3015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373248559
80	NC_016750	TAT	2	6	3020	3025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373248559
81	NC_016750	TAG	2	6	3106	3111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	373248559
82	NC_016750	TAA	2	6	3125	3130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373248559
83	NC_016750	TAC	2	6	3217	3222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	373248559
84	NC_016750	ATT	2	6	3230	3235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373248559
85	NC_016750	ATGG	2	8	3329	3336	25 %	25 %	50 %	0 %	373248559
86	NC_016750	TAA	2	6	3353	3358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373248559
87	NC_016750	A	7	7	3384	3390	100 %	0 %	0 %	0 %	373248559
88	NC_016750	ATT	3	9	3422	3430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373248559
89	NC_016750	AT	3	6	3511	3516	50 %	50 %	0 %	0 %	373248559
90	NC_016750	AGG	2	6	3525	3530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016750	CAA	2	6	3546	3551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	373248560
92	NC_016750	CGT	2	6	3627	3632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	373248560
93	NC_016750	GTGA	2	8	3675	3682	25 %	25 %	50 %	0 %	373248560
94	NC_016750	TCAT	2	8	3745	3752	25 %	50 %	0 %	25 %	373248560
95	NC_016750	CAA	2	6	3798	3803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	373248560
96	NC_016750	CAA	2	6	3834	3839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	373248560
97	NC_016750	TTA	2	6	4035	4040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373248560
98	NC_016750	ATA	2	6	4127	4132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373248560
99	NC_016750	CTA	2	6	4135	4140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016750	T	6	6	4170	4175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016750	TATT	2	8	4185	4192	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016750	A	6	6	4205	4210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016750	GA	3	6	4225	4230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016750	CAA	2	6	4257	4262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016750	TCA	2	6	4267	4272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016750	TAC	2	6	4287	4292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016750	ATA	2	6	4360	4365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016750	TAT	2	6	4404	4409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016750	GAA	3	9	4415	4423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016750	GAAA	2	8	4543	4550	75 %	0 %	25 %	0 %	373248561
111	NC_016750	AGC	2	6	4562	4567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	373248561
112	NC_016750	TA	3	6	4678	4683	50 %	50 %	0 %	0 %	373248561
113	NC_016750	ACG	2	6	4751	4756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	373248561
114	NC_016750	AAAT	2	8	4757	4764	75 %	25 %	0 %	0 %	373248561
115	NC_016750	AT	3	6	4824	4829	50 %	50 %	0 %	0 %	373248561
116	NC_016750	GAA	2	6	4840	4845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373248561
117	NC_016750	AG	3	6	4925	4930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016750	TAA	2	6	5014	5019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373248562
119	NC_016750	T	6	6	5193	5198	0 %	100 %	0 %	0 %	373248562
120	NC_016750	TTGT	2	8	5219	5226	0 %	75 %	25 %	0 %	373248562
121	NC_016750	GCTT	2	8	5355	5362	0 %	50 %	25 %	25 %	373248562
122	NC_016750	TCA	2	6	5430	5435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	373248562
123	NC_016750	ATTA	2	8	5464	5471	50 %	50 %	0 %	0 %	373248563
124	NC_016750	T	6	6	5482	5487	0 %	100 %	0 %	0 %	373248563
125	NC_016750	AAT	2	6	5506	5511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373248563
126	NC_016750	AGT	2	6	5525	5530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	373248563
127	NC_016750	CGA	2	6	5538	5543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	373248563
128	NC_016750	A	7	7	5602	5608	100 %	0 %	0 %	0 %	373248563
129	NC_016750	CAATC	2	10	5626	5635	40 %	20 %	0 %	40 %	373248563
130	NC_016750	TCA	2	6	5733	5738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	373248563
131	NC_016750	TAA	2	6	5740	5745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373248563
132	NC_016750	AAG	2	6	5777	5782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373248563
133	NC_016750	ATT	2	6	5791	5796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373248563
134	NC_016750	TG	3	6	5815	5820	0 %	50 %	50 %	0 %	373248563
135	NC_016750	TAA	2	6	5847	5852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373248563
136	NC_016750	ATGA	2	8	5926	5933	50 %	25 %	25 %	0 %	373248563
137	NC_016750	AAT	2	6	6011	6016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373248563
138	NC_016750	AGAA	2	8	6019	6026	75 %	0 %	25 %	0 %	373248563
139	NC_016750	ATG	2	6	6105	6110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	373248563
140	NC_016750	A	7	7	6172	6178	100 %	0 %	0 %	0 %	373248563
141	NC_016750	TTCATC	2	12	6235	6246	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	373248563
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275	NC_016750	A	6	6	12441	12446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_016750	TAT	2	6	12458	12463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_016750	AT	3	6	12462	12467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_016750	TA	3	6	12474	12479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_016750	A	6	6	12551	12556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_016750	TA	3	6	12562	12567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_016750	A	6	6	12573	12578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_016750	TA	3	6	12584	12589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_016750	A	6	6	12595	12600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_016750	TA	3	6	12606	12611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_016750	A	6	6	12617	12622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_016750	TAT	2	6	12639	12644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_016750	ATA	2	6	12648	12653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_016750	ACG	2	6	12672	12677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_016750	TCAC	2	8	12705	12712	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.